朱元璋從陳友諒的逃兵那兒得到情報，弄清楚他們進攻的路線，就讓大將徐達、常遇春等分幾路在沿江幾個重要關口埋伏了人馬。朱元璋親自統率大軍守在盧龍山（今南京獅子山），布置兵士準備好紅黃兩面旗幟，規定了信號：舉起紅旗就是通知敵人已經到來，舉起黃旗就是命令伏兵出擊。一切都準備好了，只等陳友諒自投羅網。

　　陳友諒自從老仆走后，立刻下令全體水軍出發，由他親自帶領，直駛江東橋。哪想到到了約定地點，竟沒見木橋，只有石橋。陳友諒的部將們都起了疑心。陳友諒想，別管他是石橋還是木橋，只要找到康茂才就好。他就到石橋旁邊，一連喊了幾聲“老康”，也沒人答應。陳友諒這才想到自己上了當，急忙命令船隊撤退。

　　朱元璋發現敵人中計，立刻叫兵士舉起黃旗，發動進攻。一霎眼間，戰鼓齊鳴，岸上伏兵一起殺出，水港里的水軍也加入戰斗。

　　陳友諒受到突然襲擊，幾萬大軍一下子亂了套，被殺死的和落水淹死的數也數不清，兩萬兵士、一百多艘戰船被朱元璋的將士俘獲。陳友諒在部將保護下，搶了一條小船，總算逃了命。

　　這一仗打得陳友諒大傷元氣。朱元璋的聲勢卻越來越大。陳友諒哪肯甘心，他養精蓄銳，決心要報這個仇。過了三年，他造了大批戰船，又帶領六十萬大軍，進攻洪都（今江西南昌）。

　　朱元璋親自帶領二十萬大軍援救洪都，陳友諒才撤去包圍，把水軍全部撤到鄱陽湖。朱元璋把鄱陽湖出口封鎖起來，堵住敵人，決定跟陳友諒在湖里決戰。

　　陳友諒的水軍有大批戰船，又高又大，一字兒排開，竟有十幾里長；朱元璋的水軍，卻盡是一些小船，論實力比陳友諒差得多。雙方連續打了三天，朱軍都失敗了。

　　部將郭興跟朱元璋說：“雙方的兵力相差太遠，靠打硬仗不行，非用火攻不可。”

　　朱元璋立刻命令用七條小船，裝載著火藥，每條船尾帶著一條輕快的小船。那天傍晚，正好刮起了東北風，朱元璋派了一支敢死隊駕駛這七條小船，乘風點火，直沖陳友諒大船。風急火烈，一下子就把漢軍大船全部延燒起來，火焰騰空，把湖水照得通紅。陳友諒手下的將士不是被燒死，就是被俘虜。

　　陳友諒帶著殘兵敗將向鄱陽湖口突圍。但是湖口早已被朱元璋堵住。在陳友諒突圍的時候，朱軍一陣亂箭，把陳友諒射死。

　　朱元璋消滅了南方最大的割據勢力陳友諒以后，自稱吳王。

　　自從劉福通犧牲以后，朱元璋把小明王接到滁州，名義上還接受小明王的領導。到了這時候，他做皇帝的思想膨脹起來，覺得留著小明王對他是個障礙。公元１３６６年，他用船把小明王接到應天，趁小明王在瓜步（今江蘇六合東南）過江的時候，派人暗暗鑿沉了船，把小明王淹死。

　　第二年，朱元璋消滅了張士誠割據勢力，接著，命令徐達為征虜大將軍，常遇春為副將軍，率領二十五萬大軍北伐。過了兩個月，徐達的軍隊旗開得勝，占領了山東。公元１３６８年正月，朱元璋在應天即位稱皇帝，國號叫明。他就是明太祖。

　　明軍乘勝進軍，元兵節節敗退。這年八月，徐達率領大軍直搗大都，元順帝逃往上都。統治中國九十七年的元王朝終于被推翻。