打那以后，江南大族紛紛擁護司馬睿，司馬睿在建康就站穩了腳跟。

　　北方發生大亂以后，北方的士族地主紛紛逃到江南來避難。王導又勸說司馬睿把他們中間有名望的人都吸收到王府來。司馬睿聽從王導的意見，前前后后吸收了一百零六個人，在王府里做官。

　　司馬睿聽從王導的安排，拉攏了江南的士族，又吸收了北方的人才，鞏固了地位，心里十分感激王導。他對王導說：

　　“你真是我的蕭何啊！”

　　公元３１７年，司馬睿在建康即位，重建晉朝。這就是晉元帝。在這以后，晉朝的國都在建康。為了和司馬炎建立的晉朝（西晉）相區別，歷史上把這個朝代稱為東晉。

　　晉元帝登基的那天，王導和文武官員都進宮來朝見。

　　晉元帝見到王導，從御座站了起來，把王導拉住，要他一起坐在御座上接受百官朝拜。

　　這個意外的舉動，使王導大為吃驚。因為在封建時代，是絕對不允許有這樣的事的。王導忙不迭推辭，他說：“這怎么行。如果太陽跟普通的生物在一起，生物還怎么能得到陽光的照耀呢？”

　　王導這一番吹捧，使晉元帝十分高興。晉元帝也不再勉強。但是他總認為他能夠得到這個皇位，全靠王導、王敦兄弟的力量，所以，對他們特別尊重。他封王導擔任尚書，掌管朝內的大權；又讓王敦總管軍事。王家的子弟中，很多人都封了重要官職。

　　當時，民間流傳著一句話，叫做“王與馬，共天下”。意思就是王氏同皇族司馬氏共同掌握了東晉的大權。

　　王敦掌握軍權，自以為了不起，把晉元帝不放在眼里。晉元帝也看出了王敦的驕橫，另外重用了大巨劉隗和刁協，對王氏兄弟漸漸疏遠起來。這樣，剛剛建立的東晉王朝內部就出現了裂痕。